Ce sont les Grecs (Rums) réfugiés de Crimée qui construisirent l'église Notre Dame de Caffa en 1475. Plusieurs fois détruite et reconstruite, l'église actuelle date de 1840. Depuis 1924, Notre Dame de Caffa est l’église patriarcale des Turcs.

L'église saint Benoît a probablement été fondée sous le pape Urbain V (1362 - 1379) pour remplacer l’église génoise de Saint Michel. Quand les derniers Maures furent chassés de Grenade, Soliman le Magnifique ordonna de convertir l’église en mosquée pour les réfugiés. Le roi de France François 1er intervint auprès du sultan pour en faire la chapelle royale de l’ambassade, ce qui permit aux Jésuites de garder l’édifice et ses dépendances. L’église saint Benoît fut plusieurs fois victime d'incendies, mais fut à chaque fois restaurée et agrandie. Aux 17e et 18e siècles, Saint Benoît avait une réelle importance et on y célébrait la messe en latin, grec et arménien dans les trois rites différents. Les bâtiments furent encore endommagés par l’incendie de 1731, puis l’ordre des Jésuites fut supprimé par Clément XIV et ce sont les Lazaristes qui en prirent possession en 1783. En 1839, l’ordre des Filles de la Charité ouvrit une école qui fut agrandie en 1871. Les incendies et les tremblements de terre n’ont pas laissé l’église intacte et on y trouve un mélange de styles s’étalant sur 800 ans.

L’une des plus grandes écoles catholiques d'Istanbul a été fondée par les Jésuites en 1583. Fermée à plusieurs reprises, elle fut léguée aux Lazaristes à l’abolition de l'ordre des Jésuites en 1773. A partir de 1839, des classes s’ouvrirent aux filles et fusionnèrent avec celles des garçons en 1989. Aujourd'hui, le lycée Saint Benoît qui dispense un enseignement laïc de qualité reçoit environ 1500 élèves, principalement musulmans, et jouit d’un grand prestige auprès de la population aisée d'Istanbul.

En 1958, l'église de Saint Grégoire a été démolie pour agrandir le boulevard Kemeralti. Une nouvelle église fut érigée un peu plus au Sud. Bien que récente, l'église de Saint Grégoire l'Illuminateur est la seule église arménienne d’Istanbul qui soit construite dans le style des anciennes églises arméniennes.

D’après d'anciens textes, il y avait une église arménienne à l'emplacement de l'église saint Grégoire l'Illuminateur, avant même l’urbanisation du secteur en 1431. Plus tard, un autre sanctuaire fut construit, mais il fut détruit par un incendie. Au 19e siècle, un nouveau bâtiment remplaça l’ancien, auquel furent ajoutées des dépendances en 1886.